La Subdirección de Empleo y Seguridad Social (SESS) tiene a cargo el análisis de los sectores seguridad social integral, protección laboral, mercado laboral y empleabilidad, y formación para el trabajo con sus respectivos componentes, como se muestra en el siguiente diagrama:

Con respecto a todos los anteriores sectores y tópicos, la SESS está encargada de formular políticas, así como de orientar y promover planes, programas, estudios técnicos y proyectos de inversión, junto con los organismos y entidades pertinentes. Adicionalmente desarrolla y orienta el seguimiento, control y evaluación a la ejecución de las políticas, planes, programas y proyectos asociados y recomienda las modificaciones necesarias.
Una de sus funciones también es coordinar y evaluar la programación del presupuesto de inversión de los organismos y entidades públicas del orden nacional, en los sectores de mercado laboral, pensiones y riesgos profesionales. Además evalúa los planes, programas y proyectos de inversión de las entidades relacionadas con estos sectores para fundamentar los conceptos técnicos respectivos y su posible incorporación al Banco de Programas y Proyectos de Inversión Nacional, en función de las necesidades y del Plan Nacional de Desarrollo.
Esta subdirección apoya la preparación de normas requeridas sobre la organización, el funcionamiento y la gestión institucional en los sectores de mercado laboral, pensiones y riesgos profesionales y así adelantar las políticas, planes, programas y proyectos correspondientes.
Finalmente, desde aquí se brinda apoyo técnico en la conformación, consolidación y mantenimiento de los sistemas de Protección Social y de Manejo Social del Riesgo en el país, también se brinda asistencia técnica en aspectos específicos que demandan las entidades del sector con respecto a las políticas y programas de inversión.