Es responsable, entre otras funciones, de la formulación de políticas, programas y proyectos de inversión en salud, familia, infancia, envejecimiento y vejez, y riesgos ambientales; apoya la preparación de normas sobre la organización, el funcionamiento y la gestión institucional requeridos para adelantar las políticas, planes, programas y proyectos; igualmente, da soporte técnico a la conformación, consolidación y mantenimiento de los sistemas de Protección Social y de Manejo Social del Riesgo en el país, y brinda asistencia técnica en aspectos específicos frente a la demanda de las entidades del sector en relación con las políticas y programas de inversión.
Las funciones de las Subdirección de Salud se llevan a cabo en el marco de las orientaciones y normatividad establecidas por el Sistema General de Seguridad Social en Salud en el país.
Así, el marco normativo que orienta las acciones de cada uno de los ámbitos de "aseguramiento, prestación de servicios y salud pública", se soportan principalmente en: la Ley 100 de 1993, la Ley 715 de 2001, la Ley 1122 de 2007, los Acuerdos del Consejo Nacional de Seguridad Social en Salud.
Para acceder a la información detallada sobre cada una de estas normas y su respectiva reglamentación, puede seguir los siguientes vínculos establecidos con la página Web de la Secretaría del Senado de la República, la cual contiene la vigencia expresa de las Leyes, y pronunciamientos de la Corte Constitucional respecto a las Leyes, desde la Ley 1 de 1992 hasta el 2007. Además, incluye Decretos Modificatorios de Leyes de 1992 a 2002.
- Ley 100 de 1993. Establece el Sistema de Seguridad Social Integral, y lo de fine como "el conjunto de instituciones, normas y procedimientos, de que disponen la persona y la comunidad para gozar de una calidad de vida, mediante el cumplimiento progresivo de los planes y programas que el Estado y la sociedad desarrollen para proporcionar la cobertura integral de las contingencias, especialmente las que menoscaban la salud y la capacidad económica, de los habitantes del territorio nacional, con el fin de lograr el bienestar individual y la integración de la comunidad.
- Ley 715 de 2001. Dicta normas orgánicas en materia de recursos y competencias y organiza la prestación de los servicios de salud, educación, saneamiento y agua potable, entre otras.
- Ley 1122 de 2007. Realiza ajustes al Sistema General de Seguridad Social en Salud, teniendo como prioridad el mejoramiento de la prestación de los servicios a los usuarios.
- Consejo Nacional de Seguridad Social en Salud. Organismo de dirección del Sistema General de Seguridad Social en Salud de carácter permanente.